技術(shù)服務(wù)

高通量DNA測(cè)序技術(shù)為分析抗體基因序列, 特別是針對(duì)大容量、多樣性高的抗體基因庫(kù)序列的系統(tǒng)分析提供了可能。

對(duì)測(cè)序得到的原始數(shù)據(jù)(Raw reads)進(jìn)行質(zhì)量控制，濾掉質(zhì)量低與長(zhǎng)度短的讀段并獲得干凈的數(shù)據(jù)(Clean reads)；利用IgBlast和 IMGT對(duì)抗體的可變區(qū)進(jìn)行V(D)J生殖系基因定位(VDJ annotation)；根據(jù)生殖系基因定位將每個(gè)合并的讀段剪切至恰好包含整個(gè)可變區(qū)域；去除冗余數(shù)據(jù)，對(duì)于每個(gè)唯一讀段(Unique reads)記錄其總數(shù)量；系統(tǒng)化注釋獲得 reads 的可變區(qū)域并提取CDR3區(qū)域；分析CDR3區(qū)域并獲得抗體的家系信息(Clone or lineage)；獲得每個(gè)家系中輕重鏈可變區(qū)域的序列特性，并利用重鏈和輕鏈各家系的reads數(shù)量進(jìn)行輕重鏈配對(duì)；對(duì)配對(duì)好的抗體序列通過(guò)實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證功能。

服務(wù)優(yōu)勢(shì)：
1.采用RACE技術(shù)和專門(mén)優(yōu)化的PCR擴(kuò)增體系與程序，真實(shí)體現(xiàn)免疫系統(tǒng)發(fā)育過(guò)程
2.多樣化的NGS分析平臺(tái)
3.成功率高與快速交付速度
4.完備的生物信息學(xué)分析，深度挖掘高價(jià)值信息

應(yīng)用方向：
1.開(kāi)發(fā)高親和力抗體
2.縮短單克隆抗體開(kāi)發(fā)周期

服務(wù)內(nèi)容：


客戶提供：
免疫原相關(guān)信息

交付內(nèi)容：
1. NGS測(cè)序數(shù)據(jù)
2. 生物信息學(xué)數(shù)據(jù)分析結(jié)果
3. 重組抗體的序列信息與構(gòu)建
4. 重組抗體的驗(yàn)證結(jié)果
4. 實(shí)驗(yàn)周期3-5個(gè)月