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      KASP SNP基因分型|SNP基因分型

      KASP SNP基因分型|SNP基因分型

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      技術原理:
      KASP-競爭性等位基因特異性PCR(Kompetitive Allele-Specific PCR),該技術是基于引物末端堿基的特異匹配來對SNP分型以及檢測InDels (Insertions and Deletions,插入和缺失),采用2個熒光探針、2個通用淬滅探針,再加多個位點特異探針來檢測多個SNP位點,采用全自動核酸提取儀、熒光定量PCR平臺,靈活采用96孔板、384孔板,一天可檢測幾萬個SNP 位點。

      KASP技術原理上類似Taqman檢測,也是基于終端熒光讀取判斷,每孔采用雙色熒光檢測一個樣本的一個位點可能的兩種基因型,而KASP技術與Taqman技術不同的是,它不需要每個SNP位點都去合成特異的熒光引物,它基于自己獨特的ARM PCR原理,讓所有的位點檢測最終都使用通用熒光引物擴增,這大大降低了LGC KASP的試劑成本,既有金標準的準確,又降低了使用成本,比Taqman還具有更好的位點適應性,所以在醫(yī)學、農(nóng)學檢測方面KASP都有非常好的應用。

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      服務內(nèi)容:根據(jù)客戶的要求和課題特點,提供一站式SNP基因分型服務
      1、課題的設計咨詢包括檢測位點的篩選;
      2、全血和組織樣本基因組DNA提?。ㄙM用另算);
      3、DNA樣本的質(zhì)檢;
      4、根據(jù)樣品數(shù)量和分型位點數(shù),推薦成本最低的分型方法;
      5、SNP分型所用引物的設計、合成與優(yōu)化;
      6、SNP基因分型;
      7、分型數(shù)據(jù)的質(zhì)量質(zhì)控;
      8、提交實驗報告

      客戶需要提供:
      1. 細胞,組織或血液等樣品材料,基因組DNA提取費用單獨收費;
      2. 基因組DNA(體積≥30μl,濃度≥50 ng/μl),純度 OD260/280 為1.7~1.9之間;
      3. 人類基因組需提供SNP位點的RS號。其它物種如牛、雞、魚等無rs號的,需提供SNP位點上下游各200bp的確切序列,SNP位點的突變類型,以及位點的上下游25bp內(nèi)是否存在其它連鎖位點。

      最終提交結果:
      1. SNPs結果(ExceL表格);
      2. 完整實驗報告:擴增和反應體系、所涉及的引物、探針序列;



      KASP技術特點:
      1.優(yōu)異的準確性
      - 獨立評價的準確性>99.8% 
      - 業(yè)內(nèi)領先的SNP&InDel 分析的轉化率(>90%)
      2.超強的靈活性
      - 設計的高度靈活性帶來更高的成功率
      - 支持低/中/高通量研究以及單個重復實驗
      - 對液體處理系統(tǒng),PCR儀和熒光分析儀等設備有良好的兼容性
      3.前所未有的低成本
      - 無需昂貴的雙色標記探針,同樣成本獲得兩倍數(shù)據(jù)量
      - 最低的DNA樣本需求 (根據(jù)基因組大小不同只需 0.1-10 ng) 
      - 無需全基因組擴增 (Whole Genome Amplification, WGA)

      由于KASP實驗方案的高度靈活性,其應用也十分廣泛,適合于各種基因分型研究,無論是中低通量SNP研發(fā)項目,NGS之后的SNP驗證,農(nóng)業(yè)種群研究,或者大量種子的生產(chǎn)QC和生物樣品庫 DNA Biobanking等都是其適用的范圍。

      實驗步驟:

      實驗結果散點圖:


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